21世纪末,人类的科技水平已高度发达,克隆人技术和宇宙航行早已不再是梦想。与此同时,许多科学家仍孜孜不倦追索着人类起源的秘密与真相。
通过对许多古老文明的考察与对比,科学家伊丽莎白·肖和查理·赫洛维发现,人类可能是由来自一个遥远星系的外星人创造的。当人类在这些超古代文明中发现了他们星球的坐标后,为了与自己的创造者进行第一次接触,人类造出了普罗米修斯号飞船,飞向我们称之为天堂的星球。
但在人类与造物者接触后却遭到造物者的袭击,并且发现这些有机物质都是生物武器,而创造者的最终目的地居然是地球。为防止这些可怕的生物武器前往地球,于是人类用普罗米修斯飞船撞毁了准备飞往地球的创造者飞船。